Usage Mitochondrial 16S rRNA Gene as molecular marker in taxonomy of Cyprinin fish Species (Cyprinidae Teleostei) استخدام جين 16S rRNA المايتوكونديري كمؤشر جزيئي في تصنيف أنواع أسماك الشبوطيات من العائلة الثانوية Cyprininae

Abstract

لتأكيد الحالة التصنيفية لسبعة أنواع من أسماك الشبوطيات من العائلة الثانوية Cyprininae وهي سمكة الكطان Barbus xanthopterus وسمكة الحصان B kersin وسمكة النباش B barbulus وسمكة الشبوط B grypus وسمكة البني B sharpeyi وسمكة الحمري B luteus وسمكة الكارب الشائع Cyprinus carpio استخدمت قطعة جين 16S rRNA المايتوكونديري كمؤشر جزيئي وتم تحوير بادئ ليتضمن قطعة محددة بـ 120 زوج قاعدي فحص ناتج تضخيم الجين بتقنية PCR بترحيله كهربائيا على هلام الأكروز 20 % وقدر حجم الحزم الظاهرة في الصورة باستخدام المسطرة الجزيئية 100 زوج قاعدي وقد كان الارتباط عاليا حيث كانت قيمة معامل الارتباط 099 < R2 استجابت أنواع جنس Barbus الستة فضلا عن الكارب الشائع للبادئ وأنتجت عملية التضخيم قطعة جين 120 زوج قاعدي بينما تبين في هلام الأكروز بأن سمكتي الخشني Liza abu وسمكة البياح الأخضر Liza klunzingeri اللتان تعودان إلى عائلة Mugilidae واللذان استخدما كمجموعة خارجية من عائلة أخرى، وسمكة الشلك Aspius vorax التي تعود إلى عائلة الشبوطيات ذاتها للعائلة الثانوية Leuciscinae كمجموعة خارجية من عائلة ثانوية أخرى لم تستجب للبادئ، في الوقت الذي استجابت فيه السمكة الذهبية Carassius auratus التي تعود إلى ذات العائلة الثانوية Cyprininae استنتجت الدراسة بأن الأنواع الستة من جنس Barbus كما هو الحال في الكارب الشائع عائدة إلى العائلة الثانوية Cyprininae

To confirm the taxonomical status of seven cyprinin fish species in Iraqi inland waters Barbus xanthopterus B kersin B barbulus B grypus B sharpeyi B luteus and Cyprinus carpio the mitochondrial 16S rRNA gene fragment was used as a molecular marker The primer was modified to include limited 120 bp fragment PCR product tested on 2 % agarose gel electrophoresis The size of bands was estimated using the 100 bp ladder while the correlation between the size of 100 bp ladder bands and the migrated distance was high since the R2 > 099 Molecular profile of mtDNA 16S rRNA gene fragment appeared that the six Barbus species and Cyprinus carpio had responded similarly to the modified primer Whereas the second profile showed that the muglid Liza abu and Liza klunzingeri (used as outgroup family) and leuciscin A vorax (outgroup subfamily) did not respond to the modified primer but the cyprinin Carassius auratus responded and the marker band of 120 bp length proved that this species also belongs to subfamily Cyprininae