RAPD and STS Markers Linked to stripe rust resistance region Lr46 Yr29 in wheat الدلائل الجزيئية (STS & RAPD) المرتبطة بالموقع الوراثي لمقاومة الصدأ الأصفر صدأ الساق Lr46 Yr29 في القمح

Abstract

The objective of this study was to identify RAPD and STS markers linked to stripe rust resistance region Lr46 Yr29 in F3 population of wheat by using the bulked segregant analysis method F3 population has been derived from the cross between the stripe rust resistance parent (monogenic line Lr46 Yr29) and the susceptible parent (Sids6) and the evaluation to stripe rust resistance was made at adult stage Bulk segregant analysis was used in conjunction with RAPD analysis After Mapmaker linkage analysis on the F3 population a standard maximum likelihood technique was employed to analyze the linkage between Yr29 and the linked marker loci The genetic distance between Lr46 Yr29 gene and RAPD marker (OPB8280) was 128 cM with LOD scores of 64 Two STS primers BE518048 and TC265717 were tested by using different PCR programs with different annealing temperatures to reveal polymorphism between the monogenic line Lr46Yr29 and the cultivar Sids6 EST based STS marker BE518048600 was mapped to Lr46 Yr29 gene by using the bulked segregant analysis (BSA) procedure with the same previous population After Mapmaker linkage analysis on the F3 population a standard maximum likelihood technique was employed to analyze the linkage between Yr29 and the linked marker loci The genetic distance between Lr46 Yr29 and STS marker BE518048 600 was 113 cM with LOD scores of 7 RAPD and STS markers results revealed that Sids6 has not Yr29 which linked to Lr46 when evaluated to stripe rust resistance at adult stage The availability of such RAPD and STS markers should accelerate the introgression of the resistance gene into current wheat cultivars It will also facilitate the accumulation of several resistance genes in a target cultivar

تهدف هذه الدراسة إلى تحديد دلائل RAPD وSTS المرتبطة بجين المقاومة لصدأ الأوراق والصدأ الأصفر Lr46 Yr29 في عشيرة الجيل الثالث من القمح، باستخدام طريقة Bulked Segregant Analysis (BSA)، تم الحصول على هذه العشيرة عن طريق تهجين الأب المقاوم للصدأ الأصفر (السلالة المحتوية على Lr46 Yr29) مع الأب الحساس (الصنف المنزرع سدس6) وتم تقييم الآباء وعشيرة الجيل الثالث للمقاومة للصدأ الأصفر في مرحلة النبات الناضج وقد تم استخدام BSA مع تحليل الـRAPD، ولقد وجد بتحليل الارتباط باستخدام برنامج Mapmaker، أن الدليل OPB8280 قد أظهر ارتباطا بالجين Lr46 (LOD 64) بمسافة قدرها 128 سنتيمورجان وقد تم استخدام 2 من بادئات الـSTS وهما E518048 وTC265717 باستخدام برامج مختلفة مع درجات حرارة مختلفة، لارتباط البادئات لاختبار إظهار اختلافات بين الآباء (سدس6، Lr46 Yr 29) وقد تم استخدام البادئ BE518048 في عمل خريطة وراثية لمنطقة Lr46 Yr29، وذلك باستخدام (BSA) مع STS markers ESTbased على نفس العشيرة السابقة ولقد وجد بتحليل الارتباط باستخدام برنامج Mapmaker أن الدليل BE518048600 قد أظهر ارتباطا بالجين Yr29 (LOD 7) بمسافة قدرها 113سنتيمورجان وأكدت نتائج الـدلائل RAPD وSTS أن سدس6 لا يحتوى على Lr46 Yr29 عند تقييمه للمقاومة للصدأ الأصفر في مرحلة النبات الناضج وكذلك فإن عمل خريطة وراثية باستخدام دلائلRAPD وSTS أظهر تواجد Lr46 Yr29 في النباتات المنعزلة فى الجيل الثالث فى مرحلة النبات الناضج ويمكننا القول أن إتاحة استخدام مثل هذه الـدلائل RAPD وSTS يسهل من إدخال جينات المقاومة لأصناف القمح، وأيضا يسهل من تراكم بعض جينات المقاومة في الصنف المستهدف تحسينه